โครงสร้างพื้นฐานของกล้องจุลทรรศน์ทางชีววิทยา

1. ที่ยึดกระจก อยู่บริเวณด้านล่างของกล้องจุลทรรศน์ ใช้สำหรับรองรับภาพเต็มจอ
2. แขนกระจก อยู่ด้านหลังกระบอกเลนส์ มักมีลักษณะโค้ง ใช้สำหรับรองรับกระบอกเลนส์และบริเวณจับยึดเมื่อเคลื่อนย้ายกล้องจุลทรรศน์
3. ท่อกระจก อยู่เหนือกล้องจุลทรรศน์ โดยมีเลนส์ตาส่วนบนและตัวแปลงเลนส์วัตถุส่วนล่าง
4. ตัวแปลงเลนส์วัตถุ แท่นหมุนที่อยู่ใต้กระบอกเลนส์ ซึ่งโดยปกติจะมีรูกลมๆ 3-4 รู สามารถติดตั้งเลนส์วัตถุที่มีกำลังขยายต่างกันได้ ทำให้เลนส์วัตถุแต่ละอันสามารถสร้างระบบขยายภาพโดยมีเลนส์ใกล้ตาผ่านกระบอกเลนส์ได้
5. สถานีเคลื่อนที่ เรียกอีกอย่างว่า เวที โต๊ะทำงาน หรือกระจก ใช้สำหรับวางตัวอย่าง แท่นเคลื่อนที่มีคลิปโลหะ 2 อันที่เรียกว่าคลิปตัวอย่าง ซึ่งใช้สำหรับยึดตัวอย่างสไลด์กระจก บางแท่นมีตัวดันสไลด์เพื่อเคลื่อนย้ายตัวอย่าง ในขณะที่บางแท่นสามารถเคลื่อนย้ายได้เอง
6. อุปกรณ์โฟกัส เพื่อให้ได้ภาพที่ชัดเจน จำเป็นต้องปรับระยะห่างระหว่างเลนส์วัตถุและตัวอย่าง เพื่อให้โฟกัสของเลนส์วัตถุตรงกับตัวอย่าง การทำงานนี้เรียกว่าการโฟกัส การโฟกัสทำได้โดยใช้ปุ่มโฟกัสหยาบและปุ่มโฟกัสละเอียด
7. เลนส์วัตถุ ติดตั้งอยู่ใต้ตัวแปลงเลนส์วัตถุที่ด้านล่างของกระบอกเลนส์ เรียกอีกอย่างว่าเลนส์วัตถุเนื่องจากอยู่ใกล้กับวัตถุที่กำลังดู เลนส์วัตถุเป็นส่วนประกอบที่สำคัญที่สุดที่กำหนดประสิทธิภาพของกล้องจุลทรรศน์ เช่น ความละเอียด หน้าที่ของเลนส์วัตถุคือการขยายตัวอย่างให้เป็นภาพกลับหัวเป็นครั้งแรก กล้องจุลทรรศน์มีเลนส์วัตถุหลายชิ้น โดยแต่ละชิ้นประกอบด้วยเลนส์หลายชิ้นที่มีรัศมีทรงกลมต่างกัน ยิ่งรูรับแสงของเลนส์ที่ปลายด้านล่างของเลนส์วัตถุเล็กลง กระบอกเลนส์ก็จะยาวขึ้นและกำลังขยายก็จะสูงขึ้น มิฉะนั้นจะตรงกันข้าม เลนส์วัตถุมีกำลังขยายต่ำและกำลังขยายสูง และกำลังขยายของเลนส์มักจะสลักไว้ที่กระบอกเลนส์ของเลนส์วัตถุ เช่น 4x, 8x, 10x,..., 100x ซึ่งหมายถึง 4x, 8x, 10x,... และ 100x ตามลำดับ ในจำนวนนั้น 40-65 ครั้งเรียกว่าวัตถุกำลังสูง และ 90 หรือ 100 ครั้งเรียกว่าวัตถุแช่ในน้ำมัน
8. เลนส์ตา ติดตั้งอยู่ที่ปลายด้านบนของกระบอกเลนส์ เรียกอีกอย่างว่าเลนส์ตาเพราะอยู่ใกล้กับตาของผู้สังเกต หน้าที่ของเลนส์ตาคือขยายภาพจริงที่ขยายโดยเลนส์วัตถุให้กลายเป็นภาพเสมือนซึ่งทำหน้าที่เหมือนแว่นขยาย แต่จะไม่เพิ่มความละเอียดของกล้องจุลทรรศน์ มีเส้นสีดำอยู่ในระยะการมองเห็นของเลนส์ตา เรียกว่า "ตัวชี้" ซึ่งสามารถระบุส่วนที่ต้องการสังเกตได้ หากจำเป็น อาจติดตั้งไมโครมิเตอร์ภายในเลนส์ตาเพื่อวัดขนาดของวัตถุที่สังเกตได้ โดยทั่วไป กล้องจุลทรรศน์จะมีเลนส์ตาหลายอันที่มีกำลังขยายต่างกัน และกำลังขยายของเลนส์ตาจะสลักไว้ที่กรอบเลนส์ตา เช่น 5 เท่า 10 เท่า 15 เท่า เป็นต้น (กำลังขยายรวมของกล้องจุลทรรศน์=กำลังขยายของเลนส์วัตถุ x กำลังขยายของเลนส์ตา)
9. กระจกโฟกัส ติดตั้งบนวงเล็บด้านล่างของสถานีเคลื่อนที่ ประกอบด้วยสปอตไลท์และไดอะแฟรมรูรับแสงเป็นหลัก หน้าที่ของสปอตไลท์คือรวมแสงของกล้องจุลทรรศน์และเพิ่มการส่องสว่างให้กับตัวอย่าง รูรับแสงหรือที่เรียกอีกอย่างว่ารูรับแสง ใช้เพื่อปรับความเข้มของแสง ใต้ไดอะแฟรมรูรับแสงมักจะมีตัวยึดฟิลเตอร์แบบวงกลมซึ่งสามารถวางไว้ตามความต้องการในการตรวจด้วยกล้องจุลทรรศน์
10. แหล่งกำเนิดแสง โดยปกติจะติดตั้งไว้ภายในฐานของกล้องจุลทรรศน์เพื่อให้มีแหล่งกำเนิดแสง